Jun Sakurada geht schon seit langem nicht mehr zur Schule. Zum Verdruss seiner älteren Schwester Nori sitzt er abgeschottet in seinem Zimmer und bestellt absurde Artikel im Internet. Als er eines Tages die Puppe Shinku geliefert bekommt, die zum Leben erwacht und ihn zu ihrem Diener bestimmt, wird er rasant in ihre mysteriöse Welt gezogen, in der es gilt, um das "Rosa Mystica" zu kämpfen. Schon bald tauchen andere "Rozen Maiden"-Puppen auf und es kommt zum Duell zwischen den Zwillingschwestern Souseiseki und Suiseiseki. Welche der beiden wird "überleben"?
